怀孕42天B超看不到孕囊的情况是否正常，需要根据受精卵的具体形成时间进行判断。如果时间偏晚，一般属于正常情况。但如果受精卵正常形成，则提示为不正常情况。

1、正常情况：临床上怀孕的时间是根据末次月经时间进行推算，而月经来潮、机体排卵受较多因素影响，如果女性末次月经结束后因情绪因素、环境影响等影响，可能会出现排卵推迟的情况，从而导致受精卵形成时间后移。

此时虽然是怀孕42天，但实际怀孕天数较短，进行B超检查时可能会出现看不见孕囊的情况，属于正常现象。如果机体无不适症状，建议先观察1周，再复查B超以明确诊断。

2、不正常情况：一般孕囊出现的时间在孕5周左右，怀孕42天即怀孕6周，如果女性的月经周期正常、排卵正常，则受精卵形成时间也相对正常，此时进行B超检查看不到孕囊，则属于不正常现象。

这种情况可能是由于异位妊娠导致，也可能与胚胎停育有关，部分女性可能会出现腹痛、阴道流血等表现，建议就医进一步检查，明确诊断后进行相应处理。

如果怀疑自身存在异常情况，建议及时到医院产科就诊，完善相应检查后给予针对性治疗。